Skip to content

Toll-like Receptor 3 i Geographic Atrophy w związanym z wiekiem zwyrodnieniu plamki czesc 4

2 miesiące ago

548 words

Znaleźliśmy znaczące powiązanie między allelem T niesynonimicznego kodowania SNP rs3775291 i ochroną przed atrofią geograficzną (P = 0,005 z dodatkowym modelem allelu dawkowania, iloraz szans atrofii geograficznej u heterozygot, 0,712, przedział ufności 95% [CI] , 0,503 do 1,00, iloraz szans u homozygot, 0,437, 95% CI, 0,227 do 0,839) (tabela i tabela S3 w dodatkowym dodatku). Ten SNP nie był istotnie związany z neowaskularyzacją naczyniówkową (P = 0,06) lub z miękkimi konfluentnymi druzami (P = 0,19) (tabela i tabela S4 w dodatkowym dodatku). Ryc. 1. Ryc. 1. Powiązanie wariantów Toll-like Receptor 3 (TLR3) na chromosomie 4q35 i zanikanie geograficznym. Panel A pokazuje ujemne wartości log10 P dla ośmiu polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP), co reprezentuje pozycja na chromosomie 4 (patrz także Tabela Niebieskie kwadraty reprezentują wszystkie SNP wokół rs3775291 dla serii kontrolnej przypadku Utah. Czerwone kółko reprezentuje rs3775291 dla pierwszej serii kontroli przypadku replikacji, a zielony trójkąt reprezentuje rs3775291 dla serii przypadków replikacji dla badania powikłań związanych z wiekiem. Czarne romby reprezentują trzy połączone serie kontroli przypadku. Panel B pokazuje strukturę genomową i lokalizacje genów pomiędzy 187222847 a 187243847 bp (zgodnie z danymi NCSNP budowanego przez National Center for Biotechnology 36). Czarne linie oznaczają introny, żółte pola kodujące białka w eksonach i szare pola nie-kodujące białka w eksonach genu TLR3 (NM_003265). Panel C przedstawia parami wykres Haploview dla par dla SNP wokół TLR3, na podstawie połączonych danych kontroli przypadku dla atrofii geograficznej. Ciemniejsza czerwień oznacza silniejszy brak równowagi.
Aby przetestować replikację tego związku, genotypowaliśmy uczestników niezależnej serii przypadków kliniczno-kontrolnych Amerykanów pochodzenia europejskiego, obejmujących 271 pacjentów z zaniknięciem geograficznym, 179 pacjentów z neowaskularyzacją naczyniówki i 421 nietkniętych kontroli. Istniało znaczne powiązanie rs3775291 z atrofią geograficzną (P = 5,43 × 10-4), ale nie z neowaskularyzacją naczyniówki (P = 0,18) (tabela 1). Nie znaleźliśmy istotnego związku między rs3775291 i neowaskularyzacją naczyniówkową w serii kontrolnej chińskiego przypadku Han (P = 0,51) (tabela 1). Drugi test replikacji dał znaczący związek między rs3775291 i atrofią geograficzną w serii przypadków kontrolnych składających się z uczestników AREDS europejskiego pochodzenia, obejmujących 184 pacjentów z zanikami geograficznymi i 134 kontrolami (osobnicy, którzy mieli> 60 lat, mieli mniej niż pięć małych druzów i nie ma zaburzeń nabłonka barwnikowego siatkówki [AREDS kategoria 1]) (P = 0,002) (rysunek i tabela oraz tabela S4 w dodatkowym dodatku). Połączona analiza trzech serii przypadków klinicznych pochodzenia europejskiego wykazała wysoce znaczący związek między rs3775291 a atrofią geograficzną (P = 1,24 × 10-7, skorygowaną zgodnie z metodą częstości fałszywego wykrywania). W przypadku wszystkich SNP tempo powodzenia genotypowania przekroczyło 98%, a dokładność przekroczyła 99%, co oceniono na podstawie losowego powtórnego sekwencjonowania 20% próbek we wszystkich seriach kontrolnych.
Przebadaliśmy również powiązania między związanymi z wiekiem fenotypami zwyrodnienia plamki żółtej a dwoma SNP w TLR4 (rs4986790 i rs4986791, o których wcześniej informowano, że są związane z degeneracją plamki żółtej związanej z wiekiem) .22 Nie znaleziono żadnego istotnego związku żadnego fenotypu z żadnym SNP (P> 0,05 dla wszystkich porównań) (tabela S3 w dodatkowym dodatku).
Aby wyjaśnić związek między atrofią geograficzną a TLR3, przeanalizowaliśmy blok sprzężono-nierównowagi i haplotypy poprzez genotypowanie sześciu dodatkowych SNP otaczających rs3775291 w trzech seriach kontroli pochodzenia europejskiego pochodzenia
[hasła pokrewne: stomart opole, stomart opole, trądzik różowaty leczenie ziołami ]

0 thoughts on “Toll-like Receptor 3 i Geographic Atrophy w związanym z wiekiem zwyrodnieniu plamki czesc 4”

Powiązane tematy z artykułem: stomart opole stomart opole trądzik różowaty leczenie ziołami